FMR1基因是脆性X綜合征的致病基因,位于Xq27.3,基因長(zhǎng)38kb,含17個(gè)外顯子。外顯子之間的拼接方式有多種,從而產(chǎn)生不同的mRNA,可翻譯出不同的蛋白質(zhì)亞型。脆性X染色體智力遲鈍蛋白(fragile X mental retardation protein,F(xiàn)MRP)是FMR1基因翻譯產(chǎn)物,它是一種RNA結(jié)合蛋白,其結(jié)構(gòu)中含有能結(jié)合RNA的功能區(qū)段,同時(shí)還有細(xì)胞核輸出訊號(hào)區(qū)段(nuclear export signal,NES)和細(xì)胞核定位訊號(hào)區(qū)段(nuclear location signal,NLS)。所以FMRP的功能是和特定的mRNA結(jié)合,并將之從細(xì)胞核內(nèi)攜帶轉(zhuǎn)運(yùn)至特定的細(xì)胞漿亞區(qū)進(jìn)行翻譯。FMRP則可以在細(xì)胞核和胞漿之間來(lái)回穿梭,被認(rèn)為能夠調(diào)控神經(jīng)發(fā)育期間特異基因的表達(dá),影響神經(jīng)細(xì)胞突出的可塑性。FMRP對(duì)大腦的發(fā)育很重要,在腦的一些部位,如尾葉、丘腦、小腦、海馬、上顳回和大腦皮質(zhì),有很高的表達(dá)。超過(guò)99%的脆性X綜合征患者是由FMR1基因三核苷酸重復(fù)順序擴(kuò)增和超甲基化所致,少于1%的患者因FMR1基因部分缺失或點(diǎn)突變而致病,屬于X連鎖隱性遺傳。該病在世界各個(gè)人群中都有發(fā)現(xiàn),發(fā)病者多為男性,危害很大。
(CGG)n重復(fù)順序的擴(kuò)增程度可以分為:
1. 前突變(premutation):(CGG)n重復(fù)順序在55~200之間,通常無(wú)CpG島的超甲基化。前突變的攜帶者FMR1基因的轉(zhuǎn)錄活躍,產(chǎn)生比正常人高的mRNA,但其翻譯效率低,故FMRP產(chǎn)量比正常人的低。大量的FMR1 mRNA會(huì)和一些蛋白質(zhì)結(jié)合,在神經(jīng)細(xì)胞中形成包涵體導(dǎo)致神經(jīng)細(xì)胞功能異常甚至死亡。
2. 全突變(full mutation):重復(fù)順序超過(guò)200個(gè),見(jiàn)于男性、女性患者和女性攜帶者。擴(kuò)增后(CGG)n區(qū)和FMR1基因的啟動(dòng)子CpG島出現(xiàn)超甲基化(hypermethylation)。高度擴(kuò)增的重復(fù)順序和超甲基化抑制了FMR1基因的表達(dá),導(dǎo)致FMRP缺乏。
3. 鑲嵌性突變(mosaicism):約15%~20%的脆性X綜合征患者有鑲嵌性突變。有兩種鑲嵌狀態(tài),一種是指患者的體細(xì)胞中同時(shí)具有前突變與全突變,即重復(fù)順序長(zhǎng)度的鑲嵌;另一種是患者的體細(xì)胞中同時(shí)具有超甲基化和非甲基化的FMR1 CpG島,即甲基化的鑲嵌。這兩種鑲嵌狀態(tài)可以單獨(dú)或同時(shí)出現(xiàn),一般來(lái)說(shuō),具鑲嵌狀態(tài)的患者智力低下的程度較輕。
前突變或全突變的攜帶者與患者都有很高的幾率在青壯年時(shí)期患卵巢早衰(女性)及震顫和共濟(jì)失調(diào)綜合征(男性),且脆性綜合征突變的攜帶率非常高,做好孕產(chǎn)前及新生兒的產(chǎn)前篩查與診斷是非常重要的。
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天昊診斷使用美國(guó)Amplide X檢測(cè)技術(shù)(已獲歐洲CE-IVD認(rèn)證)檢測(cè)FXS致病基因FMR1基因的CGG重復(fù)數(shù),檢測(cè)快速準(zhǔn)確,只需要少量基因組DNA,針對(duì)致病DNA片段區(qū)域設(shè)計(jì)特異檢測(cè)熒光探針,通過(guò)PCR擴(kuò)增,再經(jīng)毛細(xì)管電泳檢測(cè)及生物信息學(xué)分析,即可精確估算FMR1基因的CGG三核苷酸串聯(lián)重復(fù)的長(zhǎng)度。
除了對(duì)FMR1進(jìn)行特異性的PCR,包括兩個(gè)特異性的引物覆蓋(CGG)n重復(fù)區(qū)域,其產(chǎn)物為全長(zhǎng)等位基因(圖2)。CGG PR PCR是通過(guò)第三個(gè)引物特異性的覆蓋三重復(fù)CGG峰,主要為了區(qū)分其和基因特異性的PCR產(chǎn)物(基因全長(zhǎng)產(chǎn)物),最后的產(chǎn)物表現(xiàn)在電泳圖上即全長(zhǎng)PCR產(chǎn)物峰及CGG重復(fù)啟動(dòng)峰(圖2B)。全長(zhǎng)峰圖可用來(lái)轉(zhuǎn)化為CGG的堿基數(shù),而PR PCR產(chǎn)物可通過(guò)三重復(fù)峰圖準(zhǔn)確判斷多達(dá) >200 CGG數(shù)量。兩種產(chǎn)物互補(bǔ)確認(rèn)CGG重復(fù)數(shù),并明確AGG的存在(如圖13)。