南京農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與技術(shù)學(xué)院近期在《Food & Function》上發(fā)表了杏鮑菇多糖(PEP)對糞便微生物組成和免疫應(yīng)答影響的文章。在恭喜天昊生物客戶發(fā)表微生物文章同時,想跟大家分享一下文章的研究思路。
英文題目: In vivo fermentation of a Pleurotus eryngii polysaccharide and its effects on fecal microbiota composition and immune response
中文題目:杏鮑菇多糖(PEP)對糞便微生物組成和免疫應(yīng)答影響
期刊名:Food & Function 影響因子: 3.2469
材料方法:
實驗設(shè)計
所有老鼠都被關(guān)在籠子里,隨機(jī)分為四組,每組10只小鼠:(1)PEP低劑量組(LP):小鼠口服給藥每公斤體重0.2克PEP;(2)PEP中劑量組(MP):小鼠口服給藥每公斤體重0.4克PEP;(3)PEP高劑量組(HP):小鼠口服給藥每公斤體重0.8克PEP;(4)對照組(蒸餾水)。所有小鼠口服給予PEP或蒸餾水在實驗周期上午9:00左右灌胃。每只小鼠口服給藥量根據(jù)每天的體重進(jìn)行調(diào)整。在實驗期6周后,收集小鼠糞便,用于糞便DNA提取。二乙基乙醚麻醉,頸椎脫臼法處死實驗小鼠,在無菌條件下,冷板上縱向解剖獲得內(nèi)容物,每節(jié)內(nèi)容物分成3等份,保存在20?°C用于短鏈脂肪酸濃度、水分含量、pH值測定。
Miseq測序
16S細(xì)菌擴(kuò)增子測序區(qū)段為:(V4)。
材料和化學(xué)品
新鮮杏鮑菇購買自當(dāng)?shù)亍?/span>6種高純度的SCFA(短鏈脂肪酸)(乙酸、丙酸、i-butyric acids、n-butyric acids、i-valeric acids、n-valeric acids)用于標(biāo)準(zhǔn)溶液的制備。
實驗動物
C57BL/6雄性小鼠(6周齡)體重20± 2克,動物適應(yīng)以下環(huán)境兩周:溫度,25 ± 2 °C;相對濕度,50 ± 5%;12/12小時光暗循環(huán)。整個實驗過程接受標(biāo)準(zhǔn)飲食。
PEP的制備與表征分析
PEP制備是根據(jù)前期研究進(jìn)行。PEP表征分析,包括純度檢測、均勻性和分子量測定、單糖組成分析、硫酸和糖醛酸含量測定、紫外(UV)光譜和傅里葉變換紅外(FT-IR)光譜分析。
研究結(jié)果:
PEP基本結(jié)構(gòu)
PEP的純度、分子量、單糖組成、硫酸根含量請見表1。在260 nm和280 nm處沒有吸收峰,光譜分析表明PEP中沒有核酸或蛋白質(zhì)存在(圖1a)。PEP的FT-IR光譜在500-4000cm?1,3399.9 cm?1位置廣闊的伸展峰代表了羥基基團(tuán)(–OH),揭示了PEP多糖鏈較強(qiáng)的分子內(nèi)與分子間相互作用(圖1b)。
表1 PEP的基本特征(純度、分子量、糖醛酸、硫酸及單糖組成)
圖1 PEP的紫外(UV)光譜和傅里葉變換紅外(FT-IR)光譜
SCFA(短鏈脂肪酸)的測定
對照組和不同劑量PEP口服小鼠的SCFA總濃度如圖2所示:相對于對照組,MP和HP喂養(yǎng)組在盲腸具有顯著較高的SCFA總濃度。相對于盲腸內(nèi)容物,結(jié)腸內(nèi)容物具有顯著較低的SCFA總濃度。隨著PEP劑量增加,盲腸和結(jié)腸內(nèi)容物中的總SCFA濃度分別從13.41 ± 1.78 mmol L ?1,5.91 ± 1.23 mmol L?1增加到22.08 ±1.74 mmol L?1 ,7.40 ± 1.65mmol L?1。
圖2 對照組和不同劑量PEP口服小鼠結(jié)腸和盲腸內(nèi)容物的SCFA總濃度
相對于對照組,高劑量PEP喂養(yǎng)組(HP)在盲腸具有顯著較高的乙酸濃度(圖3a),然而結(jié)腸在對照組和PEP喂養(yǎng)組無顯著變化。相對于對照組,高劑量PEP喂養(yǎng)組(HP)在盲腸具有顯著較高的丙酸濃度(圖3b),然而結(jié)腸在對照組和PEP喂養(yǎng)組無顯著變化。相對于對照組,高劑量PEP喂養(yǎng)組(HP)在盲腸具有顯著較高的兩種丁酸濃度(圖3c,d)。相對于對照組,高劑量PEP喂養(yǎng)組(HP)在盲腸和結(jié)腸都具有顯著較高的i-valeric濃度(圖3e)。而n-valeric在對照組和PEP喂養(yǎng)組的盲腸無顯著變化(圖3f)。
圖3對照組和不同劑量PEP口服小鼠結(jié)腸和盲腸內(nèi)容物的乙酸(A)、丙酸(B)、i-butyric acids (C)、n-butyric acids (D)、i-valeric acids (E)、n-valeric acids (F)。
結(jié)腸和盲腸內(nèi)容物pH值和含水量
口服PEP后,結(jié)腸和盲腸內(nèi)容物的pH值隨著PEP劑量增加而降低(圖4a),這可能是由于胃腸道微生物的PEP發(fā)酵產(chǎn)物所致。口服PEP后,結(jié)腸和盲腸內(nèi)容物的含水量隨著PEP劑量增加而升高(圖4b),這可以歸因于整個實驗期間胃腸道內(nèi)容物PEP強(qiáng)大的持水能力。
圖4 對照組和不同劑量PEP口服小鼠結(jié)腸和盲腸內(nèi)容物的pH值(A)和含水量(B)。
糞便微生物組成
口服PEP 會導(dǎo)致糞便豐富度增加。厚壁菌、擬桿菌、變形桿菌是主要的門,相對于對照組,高劑量PEP喂養(yǎng)組厚壁菌門的相對豐度明顯減少,而擬桿菌門明顯增加(圖5a);綱水平,高劑量PEP喂養(yǎng)組Bacterioidia 和Bacilli的相對豐度增加, Clostridia的相對豐度減少(圖5b);目水平,高劑量PEP喂養(yǎng)組Bacteroidales和Lactobacillales的相對豐度顯著增加,Clostridiales的相對豐度減少(圖5c);科水平,高劑量PEP喂養(yǎng)組Porphyromonadaceae,Rikenellaceae,Bacteroidaceae,Lactobacillaceae的相對豐度顯著增加,Lachnospiraceae and Ruminococcaceae的相對豐度減少(圖5d);
圖5對照組和不同劑量PEP口服小鼠糞便菌群在門(A)、綱(B)、目(C)、科(D)水平上的分類。0–1到0–10, 1–1到1–10, 2–1到2–10,3–1到3–10糞便代表對照組,LP組,MP 組,HP組。
小鼠糞便菌群熱圖表明低劑量PEP喂養(yǎng)組和對照組的糞便菌群比較類似,中劑量PEP喂養(yǎng)組和高低劑量PEP喂養(yǎng)組的糞便菌群比較接近(圖6)。
圖6 對照組和不同劑量PEP口服小鼠糞便菌群熱圖分析。0–1到0–10, 1–1到1–10, 2–1到2–10,3–1到3–10糞便代表對照組,LP組,MP 組,HP組。
PCoA分析顯示各組間微生物群落具有差異性(圖7)。
圖7對照組和不同劑量PEP口服小鼠糞便菌群PCoA分析。
免疫應(yīng)答分析
在全程灌胃期間,不同組別每星期小鼠體重變化沒有差異,說明不同處理組小鼠的健康狀況相同。脾臟、肝臟和胸腺指數(shù)如下表2所示。相對于對照組,高劑量PEP喂養(yǎng)組胸腺指數(shù)具有非常顯著性差異(p<0.01),脾臟、肝臟指數(shù)則有顯著性差異(p<0.05)。
表2 PEP處理對臟器指數(shù)的影響
各組血清及腸內(nèi)容物中的免疫細(xì)胞因子分泌情況如圖8所示。PEP處理后血清IL-12濃度無顯著變化。然而,相對于對照組,高劑量PEP喂養(yǎng)組的血清TNF-α,IFN-γ,IL-1,IL-2, IL-6和盲腸和結(jié)腸SlgA顯著增加,提示了PEP的免疫功能調(diào)節(jié)作用。
圖8 PEP對血清免疫細(xì)胞因子(A, TNF-α; B, IFN-γ; C, IL-1; D, IL-2; E, IL-6; F, IL-12)和盲腸(H)和結(jié)腸(I)SlgA的影響,n=10。
總結(jié):
關(guān)于天昊:
天昊生物采用Miseq PE250測序策略對細(xì)菌16S rDNA區(qū)/真菌ITS區(qū)/真菌18S rDNA區(qū)的雙V區(qū)或多種單V區(qū)進(jìn)行測序,使用低循環(huán)數(shù)擴(kuò)增,保證每個樣品擴(kuò)增的循環(huán)數(shù)統(tǒng)一;采用特殊方法可有效避免系統(tǒng)內(nèi)誤差;數(shù)據(jù)質(zhì)量高,有效序列Q30達(dá)到90%以上;加上最新升級的分析內(nèi)容和解釋詳盡的結(jié)題報告,帶您享受極致的微生物擴(kuò)增子測序體驗。