生物遺傳多樣性類研究進(jìn)展10月集錦（二）

發(fā)稿時(shí)間：2019-11-29來(lái)源：天昊生物

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1、基于微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)長(zhǎng)江江蘇段鳙增殖放流效果評(píng)估

作者：馮曉婷，楊習(xí)文，楊雪軍，劉熠，周彥鋒，方弟安，徐東坡 

作者單位：1. 上海海洋大學(xué)水產(chǎn)科學(xué)國(guó)家級(jí)實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心 2. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院淡水漁業(yè)研究中心

出版日期：2019-10

為評(píng)估長(zhǎng)江江蘇段鳙（Aristichthys nobilis）增殖放流效果，本研究基于微衛(wèi)星標(biāo)記的親子鑒定技術(shù)，選用10對(duì)擴(kuò)增效果穩(wěn)定的微衛(wèi)星熒光標(biāo)記引物，結(jié)合毛細(xì)管電泳對(duì)江蘇省內(nèi)良種場(chǎng)563尾鳙親魚和長(zhǎng)江江蘇段687尾回捕鳙進(jìn)行基因分型，并對(duì)位點(diǎn)多態(tài)性及親子鑒定結(jié)果進(jìn)行了分析。結(jié)果表明，各位點(diǎn)等位基因介于19~55之間，其觀測(cè)雜合度為0.530~0.909（平均值為0.748），期望雜合度為0.818~0.929（平均值為0.882），多態(tài)性信息含量為0.797~0.924（平均值為0.871）； Cervus3.0模擬結(jié)果顯示，當(dāng)雙親未知且置信度為95%時(shí)，10個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的累積非親權(quán)排除率為99.996%。親子鑒定結(jié)果發(fā)現(xiàn)，所有回捕鳙中有42尾與親本之間存在親子關(guān)系，被確認(rèn)來(lái)源于鳙增殖放流群體，并由此推算此次評(píng)估親本的放流子代對(duì)長(zhǎng)江江蘇段野生群體的貢獻(xiàn)率為6.11%。結(jié)果顯示該研究進(jìn)行的鳙親子鑒定技術(shù)可為長(zhǎng)江鳙增殖放流效果評(píng)估工作提供可靠的數(shù)據(jù)支撐，為長(zhǎng)江漁業(yè)資源管理提供參考資料。

 

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2、182份東北地區(qū)受保護(hù)大豆品種DNA指紋庫(kù)的構(gòu)建及分析

作者： 趙艷杰，馮艷芳，黃思思，馬瑩雪，李嬡嬡，張蝶，鄧超，韓瑞璽，唐浩

作者單位：農(nóng)業(yè)農(nóng)村部科技發(fā)展中心

出版日期：2019-10-23

為評(píng)估東北地區(qū)受保護(hù)大豆品種遺傳多樣性，利用40對(duì)SSR引物結(jié)合熒光毛細(xì)管電泳技術(shù)，構(gòu)建了182份東北地區(qū)已授予植物新品種權(quán)的大豆品種DNA指紋庫(kù)。182份大豆品種共擴(kuò)增出266種基因型，每對(duì)引物的等位變異數(shù)為4-20種不等，平均每對(duì)引物產(chǎn)生11.05種基因型。聚類分析結(jié)果表明，182份大豆品種之間的遺傳相似系數(shù)的變化范圍是0.4887-1.0000，平均相似系數(shù)為0.7785，遺傳基礎(chǔ)較窄。聚類結(jié)果顯示，182份大豆品種可聚合成13大類，黑農(nóng)系列品種間、墾豆系列品種間聚合緊密，遺傳基礎(chǔ)相對(duì)較窄，合農(nóng)系列品種間、吉育系列品種間、綏農(nóng)系列品種間距離較遠(yuǎn)，遺傳基礎(chǔ)相對(duì)較寬。考察3個(gè)DNA指紋相同的品種合農(nóng)75、合豐50號(hào)、龍墾335的田間表型，發(fā)現(xiàn)合農(nóng)75與合豐50號(hào)表型差異較小，合農(nóng)75與龍墾335表型差異較大，因此DNA指紋圖譜庫(kù)可以為特異性（可區(qū)別性）判定時(shí)輔助篩選近似品種提供參考，但品種特異性（可區(qū)別性）的最終判定還需要依靠田間種植對(duì)比試驗(yàn)。

 

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3、白菜類蔬菜種子純度SSR分子標(biāo)記鑒定

作者：徐營(yíng)莉,華德平,張紅,王超楠,黃志銀,范偉強(qiáng),溫娟娟,張斌

作者單位：1. 天津師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 2. 天津大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 3. 天津科潤(rùn)蔬菜研究所蔬菜種質(zhì)創(chuàng)新國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 4.天津市蔬菜遺傳育種企業(yè)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

出版日期：2019-10-31

種子純度是種子質(zhì)量的核心指標(biāo)，是保障優(yōu)良品種增產(chǎn)的關(guān)鍵因素。為了鑒定白菜種子純度，本研究利用72對(duì)SSR分子標(biāo)記檢測(cè)種子純度并結(jié)合田間植株形態(tài)觀察，鑒定了5個(gè)白菜類優(yōu)勢(shì)品種的種子純度，分別是珍綠6號(hào)，津夏3號(hào)，津研快綠1號(hào)，速俊228，速俊316。結(jié)果表明，從72對(duì)SSR引物中篩選出5對(duì)具有多態(tài)性的引物，能夠?qū)⒏改副九c雜交種區(qū)分開。試驗(yàn)中SSR分子鑒定結(jié)果雖略低于田間形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果，但利用統(tǒng)計(jì)學(xué)進(jìn)行顯著性分析，發(fā)現(xiàn)兩者間無(wú)顯著性差異。說(shuō)明SSR分子標(biāo)記可以用于白菜種子純度的鑒定。本研究建立了一套準(zhǔn)確、有效的品種純度鑒定體系。

 

4、郁金香SSR-PCR反應(yīng)體系的建立與優(yōu)化

作者：馬秀花，唐楠，唐道城

作者單位：青海大學(xué)青海省園林植物與觀賞園藝重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/青海大學(xué)高原花卉研究中心

出版日期：2019-10-30

為建立郁金香SSR-PCR反應(yīng)體系，本研究以36個(gè)荷蘭引進(jìn)的郁金香栽培品種和5個(gè)產(chǎn)于中國(guó)新疆的野生種為試驗(yàn)材料，采用單因素試驗(yàn)和L16(45)正交設(shè)計(jì)相結(jié)合的方法，對(duì)影響郁金香SSR-PCR反應(yīng)的Mg2+濃度、dNTPs濃度、引物濃度、模板DNA、Taq酶用量進(jìn)行優(yōu)化，建立最佳的SSR-PCR反應(yīng)體系，并利用3對(duì)引物在41份郁金香材料中驗(yàn)證反應(yīng)體系的穩(wěn)定性。結(jié)果表明：在20 μL的PCR反應(yīng)體系中，10×PCR Buffer (Mg2+ free)2 μL、Mg2+ 2.0 mmol/L、dNTPs 0.75 mmol/L、引物2.0 μmol/L、模板DNA 10 ng、Taq酶0.15 U為最優(yōu)體系；通過(guò)正交試驗(yàn)確定5個(gè)因子對(duì)SSR-PCR體系的影響程度為：模板DNA>Taq酶>引物>Mg2+>dNTPs。篩選出的3對(duì)引物在41份郁金香材料中均可擴(kuò)增出目的條帶，表明該體系的穩(wěn)定性好。本研究建立SSR-PCR反應(yīng)體系，為郁金香SSR標(biāo)記的開發(fā)以及遺傳多樣性分析、品種指紋圖譜構(gòu)建、種質(zhì)資源鑒定等方面提供了幫助。

 

5、35份重慶大茶樹種質(zhì)資源遺傳多樣性的SSR分析

作者：羅亦紓，張霞，毛君林，李華鈞，劉勤晉，童華榮，梁國(guó)魯，魏旭

作者單位：1. 西南大學(xué)食品科學(xué)學(xué)院 2. 重慶市古樹茶研究院 3. 西南大學(xué)園藝園林學(xué)院

出版日期：2019-10-14

茶樹是中國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)植物，遺傳多樣性分析對(duì)于其種質(zhì)資源的評(píng)價(jià)與保存十分重要。本研究采用SSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)35份重慶大茶樹種質(zhì)資源進(jìn)行遺傳多樣性分析，用梯度PCR儀對(duì)22對(duì)SSR引物進(jìn)行擴(kuò)增篩選，獲得21對(duì)多態(tài)性引物。用21對(duì)引物對(duì)35份大茶樹種質(zhì)擴(kuò)增，經(jīng)8%非變性聚丙烯酰胺電泳檢測(cè)，共擴(kuò)增出48個(gè)條帶，多態(tài)性條帶38個(gè)，多態(tài)帶百分率為79.17%。35份種質(zhì)的遺傳距離在0.313～0.955之間。UPGMA聚類分析顯示，35份重慶大茶樹種質(zhì)在遺傳相似系數(shù)為0.702時(shí)可分為5個(gè)聚類，親緣關(guān)系最近的是"南川1號(hào)"和"南川2號(hào)"。

 

6、基于SSR標(biāo)記的山西高粱地方品種遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)分析

作者：李萌，秦慧彬，王宇楠，閆建俊，穆志新

作者單位：1. 山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)作物品種資源研究所農(nóng)業(yè)部黃土高原作物基因資源與種質(zhì)創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/雜糧種質(zhì)資源發(fā)掘與遺傳改良山西省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室  2. 山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所

出版日期：2019-10-11

為了從分子水平分析山西省高粱地方品種的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)，本研究從140對(duì)SSR引物中篩選到22對(duì)條帶清晰且多態(tài)性穩(wěn)定的引物，對(duì)來(lái)自于山西省11個(gè)地區(qū)66個(gè)縣市的158份高粱材料進(jìn)行了遺傳多樣性分析，結(jié)果共檢測(cè)到147個(gè)等位基因的位點(diǎn)變異，平均等位基因數(shù)為6.68。每個(gè)SSR位點(diǎn)的多態(tài)性信息含量(PIC)平均為0.635，變異范圍為0.168～0.870，表明山西高粱的地方品種具有較豐富的多態(tài)性。針對(duì)11個(gè)不同地理居群的遺傳多樣性分析表明，不同的地理居群間遺傳分化水平差異較大，地理居群間存在不同程度的基因交流。無(wú)論從等位基因數(shù)、有效等位基因數(shù)還是Shannon’s信息指數(shù)上，都可以看出忻州居群的遺傳多樣性最高，而陽(yáng)泉居群的最低。針對(duì)各地理居群間遺傳距離的分析結(jié)果表明，忻州居群和晉中居群的遺傳距離最小，兩個(gè)群體的親緣關(guān)系較近，基因交流比較頻繁。而陽(yáng)泉居群和其他居群間的遺傳距離都較大，顯示陽(yáng)泉居群與其他居群之間的基因交流阻隔，進(jìn)一步顯示了陽(yáng)泉居群的獨(dú)特性?；谀Ｐ偷倪z傳結(jié)構(gòu)分析和基于遺傳距離的N-J聚類分析都將種質(zhì)材料劃分為2個(gè)類群，不同地區(qū)高粱資源居群間的遺傳關(guān)系遠(yuǎn)近與其地理信息并沒有明顯的相關(guān)性。本研究旨在為高粱種質(zhì)資源的收集、鑒定與創(chuàng)新提供理論依據(jù)。

 

7、百合熒光SSR標(biāo)記體系構(gòu)建及引物篩選

作者：周俐宏，石慧，王志剛，蔡忠杰

作者單位：1. 遼寧省農(nóng)業(yè)科學(xué)院花卉研究所 2. 沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院

出版日期：2019-10-28

為了確定百合熒光SSR-PCR反應(yīng)的最佳體系，對(duì)反應(yīng)體系和程序中的模板DNA、酶量和退火溫度進(jìn)行了優(yōu)化篩選。結(jié)果表明,適用于百合的熒光SSR-PCR反應(yīng)體系為：總體系為20μl，10×PCR buffer(Mg2+)2μl，2.5 mM dNTP 1μl，正、反引物各0.5μl，模板DNA 40 ng，Taq酶1 U，用ddH2O補(bǔ)足。反應(yīng)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性5 min，94℃（30 s）/58℃（45 s）/72℃（45 s）35個(gè)循環(huán)，最后72℃延伸10 min。利用優(yōu)化后的反應(yīng)體系對(duì)百合SSR引物進(jìn)行篩選，從50對(duì)引物中篩選出6對(duì)多態(tài)性高的SSR引物，并通過(guò)合成熒光標(biāo)記引物對(duì)77個(gè)百合品（野生）種進(jìn)行復(fù)選,驗(yàn)證了6對(duì)引物的穩(wěn)定性。該研究為百合的遺傳多樣性分析、分子標(biāo)記輔助育種等方面的進(jìn)一步研究提供了技術(shù)支持。

 

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8、款冬轉(zhuǎn)錄組SSR標(biāo)記開發(fā)及其多態(tài)性研究

作者： 賀潤(rùn)麗，韓毅麗，段靜靜，劉計(jì)權(quán)，王莉花

作者單位：1. 山西中醫(yī)藥大學(xué)中藥學(xué)院 2. 云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)與種質(zhì)資源研究所云南省農(nóng)業(yè)生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室農(nóng)業(yè)部西南作物基因資源與種質(zhì)創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

出版日期：2019-10-28 

分析款冬轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的簡(jiǎn)單重復(fù)序列標(biāo)記(SSR)位點(diǎn)信息并設(shè)計(jì)特異引物，以期為款冬分子標(biāo)記輔助育種提供有力工具。對(duì)款冬轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)庫(kù)中長(zhǎng)度1 kb以上的18938條unigene，利用MISA軟件搜索SSR位點(diǎn)信息，利用Primer3設(shè)計(jì)引物，并隨機(jī)選擇55對(duì)SSR引物分析18份不同來(lái)源款冬材料的多態(tài)性。結(jié)果共搜索到4688個(gè)SSR位點(diǎn)，分布于3844條unigene中，SSR出現(xiàn)頻率為24.75%，平均7979bp含1個(gè)SSR位點(diǎn)。SSR位點(diǎn)中三核苷酸重復(fù)類型出現(xiàn)頻率最高(37.12%)，其次是單核苷酸重復(fù)(32.36%)和二核苷酸重復(fù)(28.20%)。共有60種重復(fù)基元,其中A/T(31.42%)、AG/CT(12.80%)、ATC/ATG(9.62%)是優(yōu)勢(shì)重復(fù)基元。隨機(jī)選擇55對(duì)引物進(jìn)行多態(tài)性驗(yàn)證分析，其中42對(duì)有擴(kuò)增產(chǎn)物，14對(duì)具穩(wěn)定可重復(fù)的多態(tài)性；利用UPGMA作圖，將18份樣品分為3類?？疃D(zhuǎn)錄組中SSR位點(diǎn)出現(xiàn)頻率高，類型豐富，多態(tài)性高，為其遺傳多樣性分析、遺傳圖譜構(gòu)建和分子標(biāo)記輔助育種等研究提供了候選分子標(biāo)記。

 

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9、長(zhǎng)尾倉(cāng)鼠SSR位點(diǎn)的篩選與擴(kuò)增

作者：楊新根，張育平，郭紅芳，張建珍，武振榮，王庭林，鄒波，常文英，侯玉

作者單位：1.山西大學(xué)應(yīng)用生物學(xué)研究所，2. 山西大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 3. 山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所 4. 農(nóng)業(yè)有害生物綜合治理山西省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 5. 太原師范學(xué)院生物系 6. 五臺(tái)縣林業(yè)工作站

出版日期：2019-10-20

利用從山西省11個(gè)地市共計(jì)13個(gè)縣(市)野外捕捉的132只長(zhǎng)尾倉(cāng)鼠為試驗(yàn)材料,先提取其基因組DNA，然后應(yīng)用查閱的近源種黑線倉(cāng)鼠的6對(duì)SSR位點(diǎn)引物(已登記在GeneBank)對(duì)長(zhǎng)尾倉(cāng)鼠基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增，并對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行8%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳。結(jié)果表明,有5對(duì)引物擴(kuò)增效果較好，可用于長(zhǎng)尾倉(cāng)鼠的遺傳多樣性研究。研究結(jié)果可對(duì)今后長(zhǎng)尾倉(cāng)鼠的遺傳多樣性分析提供一定的理論基礎(chǔ)。

 

 

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10、短枝木麻黃無(wú)性系鑒定及其指紋圖譜構(gòu)建

作者：李松，張世成，董云武，施德林，史云東

作者單位：1. 玉溪師范學(xué)院化學(xué)生物與環(huán)境學(xué)院 2. 玉溪市種子管理站

出版日期：2019-10-15

本研究構(gòu)建木麻黃無(wú)性系的DNA指紋圖譜鑒定體系，為今后短枝木麻黃的品種鑒定、品種權(quán)保護(hù)、新品種的選育提供依據(jù)。從71對(duì)EST-SSR引物中篩選出擴(kuò)增條帶清晰、多態(tài)性好、擴(kuò)增穩(wěn)定的12對(duì)引物，采用降落PCR和毛細(xì)管電泳的基因分型方法，以采集的9個(gè)短枝木麻黃標(biāo)準(zhǔn)無(wú)性系的基因分型結(jié)果為參照，對(duì)華南沿海地區(qū)采集的109個(gè)短枝木麻黃無(wú)性系單株進(jìn)行鑒定，并結(jié)合引物組合法構(gòu)建基于EST-SSR分子標(biāo)記的短枝木麻黃無(wú)性系鑒定體系。結(jié)果表明，12對(duì)EST-SSR引物對(duì)109個(gè)短枝木麻黃無(wú)性系單株進(jìn)行PCR擴(kuò)增，共檢測(cè)到50個(gè)等位基因，每個(gè)位點(diǎn)的等位基因數(shù)為3～6個(gè)，平均為4.2個(gè),每對(duì)引物可區(qū)分2～5個(gè)短枝木麻黃無(wú)性系。根據(jù)鑒定結(jié)果,最終所有樣品被劃分為22個(gè)無(wú)性系,除已知的9個(gè)標(biāo)準(zhǔn)無(wú)性系外，另有13個(gè)無(wú)性系為不知名無(wú)性系，說(shuō)明不同地區(qū)的無(wú)性系存在重復(fù)命名現(xiàn)象；利用引物組合法進(jìn)一步優(yōu)化后，發(fā)現(xiàn)只需7對(duì)引物就可將22個(gè)短枝木麻黃無(wú)性系完全區(qū)分，并依此建立了基于7對(duì)EST-SSR引物的22個(gè)短枝木麻黃無(wú)性系的指紋圖譜，每個(gè)無(wú)性系都獲得了一個(gè)7位數(shù)的指紋圖譜編碼。利用7對(duì)EST-SSR引物構(gòu)建的22個(gè)短枝木麻黃無(wú)性系的DNA指紋圖譜可用于短枝木麻黃無(wú)性系的鑒別，研究表明，華南沿海地區(qū)部分短枝木麻黃無(wú)性系存在命名混亂、同物異名、無(wú)性系數(shù)量少的現(xiàn)象，新品種選育工作亟待開展和加強(qiáng)。

 

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11、大麥抗條紋病與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析

作者：司二靜，孟亞雄，李葆春，馬小樂，張宇，王化俊

作者單位：1. 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省干旱生境作物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室甘肅省作物遺傳改良與種質(zhì)創(chuàng)新重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 2. 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院 3. 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院 4. 甘肅省種子管理局

出版日期：2019-10-15

為了解不同來(lái)源大麥的遺傳多樣性，并篩選與抗條紋病性狀相關(guān)聯(lián)的SSR標(biāo)記，采用三明治法通過(guò)人工接種大麥條紋病菌對(duì)180份大麥材料進(jìn)行抗性鑒定，通過(guò)119對(duì)多態(tài)性SSR引物對(duì)180份大麥材料進(jìn)行SSR標(biāo)記分析，并用一般線性模型(general lineal model，GLM)和混合線性模型(mixed lineal model，MLM)進(jìn)行大麥抗條紋病與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果表明，人工接種大麥條紋病菌后共鑒定出10份免疫、9份高抗、25份抗病、70份感病和66份高感大麥材料；119對(duì)多態(tài)性SSR引物從180份大麥材料中共檢測(cè)出559個(gè)等位變異位點(diǎn)，平均為4.70個(gè)，變幅為2～14個(gè)，基因多樣性和多態(tài)性信息含量變幅分別為0.05～0.88和0.05～0.86；群體結(jié)構(gòu)分析表明供試大麥材料可分為2個(gè)亞群?；贕LM和MLM分別檢測(cè)到14個(gè)和10個(gè)與大麥條紋病抗性相關(guān)聯(lián)的SSR標(biāo)記，對(duì)表型變異的解釋率變幅分別為4.46%～9.76%和3.25%～7.87%,其中Scssr08238和BMS64標(biāo)記均與大麥條紋病抗性呈極顯著相關(guān)，二者在GLM中解釋率分別為9.76%和8.00%，在MLM中解釋率分別為7.87%和5.61%。本研究所鑒定的大麥抗性種質(zhì)可作為抗源用于抗病育種，與抗性相關(guān)聯(lián)的SSR標(biāo)記可用于大麥抗條紋病的分子標(biāo)記輔助選擇育種。

 

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12、利用SSR構(gòu)建甜菜品種的分子身份證

作者：栗媛，王茂芊，邳植，吳則東

作者單位：1. 黑龍江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 2. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院甜菜研究所/黑龍江大學(xué)農(nóng)作物研究院 3. 黑龍江省甜菜工程技術(shù)研究中心

出版日期：2019-10-10

為了實(shí)現(xiàn)快速鑒定甜菜品種真實(shí)性以及純度的目的，本研究利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)國(guó)內(nèi)已登記的部分甜菜品種進(jìn)行了指紋圖譜構(gòu)建。利用17對(duì)帶型清晰、重復(fù)性好、多態(tài)性高、易于識(shí)別的引物作為核心引物對(duì)39份甜菜品種的基因組DNA進(jìn)行擴(kuò)增。結(jié)果表明，只需利用以下5對(duì)核心引物：LNX38、LNX95、SB06、SSD6和SB13，便可完全鑒別出39個(gè)甜菜品種。利用SSR引物構(gòu)建甜菜品種的分子身份證，真正達(dá)到了快速、高效地鑒定品種純度以及真實(shí)性的目的，也更有效地維護(hù)了甜菜品種市場(chǎng)的秩序，并保護(hù)了育種家的利益。

 

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13、不同類型甜瓜種質(zhì)SSR遺傳多樣性及耐冷性評(píng)價(jià)

作者：徐小軍，劉海英，梁長(zhǎng)志，王吉明，張桂蘭，楊路明，胡建斌

作者單位：1. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所 2. 河南農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院

出版日期：2019-10-9

本研究從國(guó)家西瓜甜瓜種質(zhì)中期庫(kù)(鄭州)和美國(guó)農(nóng)業(yè)部國(guó)家種質(zhì)資源中心選取厚皮、薄皮和野生甜瓜種質(zhì)共191份，利用在甜瓜染色體上均勻分布的43個(gè)SSR標(biāo)記鑒定其基因型，評(píng)價(jià)其遺傳多樣性，并利用4℃恒溫條件下種質(zhì)幼苗的冷害指數(shù)和低溫處理前后的葉肉組織超微結(jié)構(gòu)變化評(píng)價(jià)不同類型種質(zhì)的耐冷性。結(jié)果顯示SSR標(biāo)記共檢測(cè)到366個(gè)等位基因，平均8.512，平均觀測(cè)雜合度和期望雜合度分別為0.074和0.704，平均多態(tài)性信息含量為0.668。UPGMA法將所有種質(zhì)聚為4個(gè)類群(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ)，Ⅰ群僅有2份印度野生種質(zhì)，Ⅱ群包含來(lái)自印度的34份野生和15份薄皮種質(zhì)，Ⅲ群含有地理分布廣泛的51份厚皮和1份野生種質(zhì)，Ⅳ群由來(lái)自東亞的75份薄皮、7份厚皮和6份野生種質(zhì)組成。Bayesian算法將所有種質(zhì)分為3個(gè)亞群(P1、P2和P3)，主要對(duì)應(yīng)厚皮、野生和薄皮3類種質(zhì)。通過(guò)計(jì)算3類種質(zhì)間的分化系數(shù)和雷氏距離，結(jié)果發(fā)現(xiàn)厚皮種質(zhì)與薄皮種質(zhì)間的分化最大，野生種質(zhì)與薄皮或厚皮種質(zhì)間的分化相對(duì)較小，不同類型種質(zhì)多樣性水平表現(xiàn)為：野生種質(zhì)>厚皮種質(zhì)>薄皮種質(zhì)。3類種質(zhì)幼苗的冷害指數(shù)趨向正態(tài)分布，薄皮種質(zhì)的耐冷性要優(yōu)于野生和厚皮種質(zhì)。葉肉組織超微觀察顯示，薄皮種質(zhì)‘蛤蟆酥5’在低溫處理前后的細(xì)胞超微結(jié)構(gòu)變化不大,其耐冷性較強(qiáng)，而厚皮種質(zhì)“鳳凰”在低溫處理后，葉綠體大量解體，細(xì)胞超微結(jié)構(gòu)遭到破壞，其耐冷性較弱。

 

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14、42份云南玉米自交系基于SSR熒光標(biāo)記的遺傳多樣性分析

作者：張鵬，管俊嬌，黃清梅，王江民，楊曉洪，劉艷芳，張建華，毛進(jìn)

作者單位：1. 云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)與檢測(cè)技術(shù)研究所

出版日期：2019-10-15

本研究通過(guò)分析云南常用42份玉米自交系品種的遺傳多樣性，以及云南近些年新育成自交系的遺傳背景，為云南地區(qū)玉米育種提供參考依據(jù)。利用30對(duì)SSR多態(tài)性引物，對(duì)42個(gè)玉米自交系品種進(jìn)行等位基因多樣性和聚類分析,共檢測(cè)到277個(gè)等位基因變異，平均每個(gè)位點(diǎn)檢測(cè)到的等位基因數(shù)為9.2個(gè)，變化范圍4～17個(gè)，片段大小介于86～434 bp之間，每個(gè)SSR位點(diǎn)的多肽信息量(PIC)在0.7008～0.9979之間，平均為0.9712?；赨PGMA進(jìn)行遺傳聚類分析，供試材料分類不明顯,遺傳相似系數(shù)均大于0.82,遺傳相似度較高。目前由于大部分的玉米自交系品種都由骨干自交系而來(lái),品種資源狹窄、遺傳多樣性不夠豐富，導(dǎo)致新育成的玉米品種遺傳背景相似，血緣關(guān)系相近，因此亟需在品種資源的有效利用、資源評(píng)價(jià)、材料共享和交流等方面開展相關(guān)工作，促進(jìn)玉米種業(yè)發(fā)展。

關(guān)于天昊：

天昊生物可以提供SSR分子標(biāo)記的一代毛細(xì)管電泳檢測(cè)，并且基于二代高通量測(cè)序技術(shù)開發(fā)出SSRseq^TM專利技術(shù), 可以根據(jù)客戶項(xiàng)目需求，提供不同數(shù)量樣本和位點(diǎn)的高性價(jià)比SSR檢測(cè)服務(wù)。此外，我們還具有豐富的動(dòng)植物葉綠體、線粒體細(xì)胞器基因組隨機(jī)測(cè)序和DNA條形碼檢測(cè)項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)，為客戶檢測(cè)提供高效的技術(shù)支撐。我們期待成為您SSR分型、細(xì)胞器基因組測(cè)序和DNA條形碼檢測(cè)的優(yōu)質(zhì)服務(wù)合作伙伴，歡迎聯(lián)系我們具體咨詢！郵箱：techsupport@geneskies.com 電話：400-065-6886